巴基斯坦位于印度和欧亚构造板块。信德省和旁遮普省是位于印度板块的西北角，而俾路支省和西北边境省的大部分是位于欧亚板块上。正是出于这个原因，巴基斯坦的地形，特別是北部省份及邻近地区，受地震震颤。
巴基斯坦西部边界是由苏莱曼山脉和吉尔特尔山脉上的开伯尔山口和柏兰山口所组成。除了丝路之外， 这两条通路是传统商业路线的一个重要部分。这些通路也被来自中亚的入侵者用作传统的入侵路线。巴基斯坦的东部和东南部边境沿着印度边界 绵延1,280公里。巴基斯坦与阿富汗共享西北部边界。
巴基斯坦的地理，可分为三个主要领域。它们分別是：沿印度河的平原，北部高地和高原。沿阿富汗边境的山脉和部分塔尔沙漠地区也是巴基斯坦的地理不可分割的一部分。北部高地包括兴都库什山脉，喜马拉雅山脉和喀喇昆仑山脉的的一部分。该地区有巴基斯坦的极端标高点：喀喇昆仑山脉的K2高峰，高八千六百一十一米，是世界第二高峰。这个地区大多数的高峰高度都超过 4500米。
虽然巴基斯坦的地理由著名和肥沃的印度河流域所组成，根据国际标準，其农业生产量是较少的。在巴基斯坦的两河水坝，即靠近塔克西拉印度河上的塔贝拉大坝和杰赫勒姆河上的曼格拉大坝，促进了巴基斯坦的农业。巴基斯坦大部分省的降雨量低，是农业生产低的主要原因之一。虽然该国其他地区获得充足的降雨量，南部和东南部的沙漠地区和金融中心卡拉奇，只有少量降雨。
